怪盜基德發出預告，將竊取在大阪展出的沙皇祕寶。警視廳特請毛利小五郎一同辦案，卻仍讓怪盜得手逃逸。在追擊之時，柯南看見基德被神祕狙擊手射中墜海，一行人將祕寶送回的途中，船上卻再度發生槍擊命案，而一切答案都藏在目的地的古堡裡！

隨著怪盜基德展開白色飛翼，跟著柯南探查地下密室。結合暗語、密碼、解鎖等本格推理元素，複合兇案、探險、飛車甚至鴿子魔術，還有灰原、平次、和葉首度參戰大銀幕，小蘭也終於開始懷疑起柯南的真面目！